瑪卡是一種一年生草本植物。其地下部分的塊狀根莖，長10至14厘米、直徑在最寬部分3至5厘米，周長為15厘米；形似小蘿卜，自然界發(fā)現(xiàn)有兩種類型的顏色，黃色和紫色，質(zhì)地稠密具有一定硬度。植物的須根呈白色，長達(dá)15厘米，在各個方向上大量延伸。葉子的長度為20至23厘米，具齒痕，葉形二回羽狀分裂，長8至13厘米，寬3厘米，生長垂向地面。葉柄很結(jié)實，可達(dá)到的長度超過10厘米，二級莖形成分支，長10到16厘米。

瑪卡是獨行菜屬中生有肥厚的下胚軸的物種。下胚軸與根融合，形成了一個粗糙倒梨形的塊根?，斂ǜ康男螤詈腕w積差距很大，有三角形、橢圓形或矩形?，斂ǖ南屡咻S可能呈金色或者淡黃色、紅色、紫色、藍(lán)色、黑色或者綠色。每一株都被認(rèn)為是獨特的基因品種。特別的性狀（主要指根的顏色）會根據(jù)其不同營養(yǎng)和特性而被特別的人工選 培育。在秘魯，淡黃色的根最常見，形狀、味道也。